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学会発表

  1. Biosynthesis of the organometallic compound: the maturation processes of [NiFe]-hydrogenases(口頭発表)
  2. Yasuhito Shomura
    The International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University
    20 Nov. 2016,Ibaraki Univ.,Mito

  3. X-ray structure analysis of the HypCD complex in the metal-bound forms(ポスター発表)
  4. Masashi Sawabe, Yoshiki Higuchi, Yasuhito Shomura
    The International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University
    18-20 Nov. 2016,Ibaraki Univ.,Mito

  5. X-ray structure analysis of the dipeptide synthetase RSp1486a(ポスター発表)
  6. Mei Hizawa, Makoto Yagasaki, Yoshiki Higuchi, Yasuhito Shomura
    The International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University
    18-20 Nov. 2016,Ibaraki Univ,Mito

  7. Fe(CN)2CO 錯体の生合成に関与するHypCD複合体の二価金属結合型構造(ポスター発表)
  8. 澤辺大嗣,樋口芳樹,庄村康人
    平成28年度 日本結晶学会年会
    2016年11月17-18日,茨城県民文化センター,水戸市

  9. ジペプチド合成酵素RSp1486aのX線結晶構造解析(ポスター発表)
  10. 樋澤芽依,矢ケ崎誠,樋口芳樹,庄村康人
    平成28年度 日本結晶学会年会
    2016年11月17-18日,茨城県民文化センター,水戸市

  11. ヒドロゲナーゼがもつ鉄硫黄クラスターの構造的多様性(口頭発表)
  12. 庄村 康人, Noor Dina Binti Muhd Noor, 西川 幸志, 樋口 芳樹
    第88回 日本生化学会大会
    2015年12月1-4日,神戸ポートアイランド,神戸市

  13. Fe(CN)2CO 錯体の生合成に関与するHypCD複合体のFe結合型構造(口頭発表)
  14. 庄村康人,樋口芳樹,Robert Szilagyi
    平成27年度 日本結晶学会年会
    2015年10月17-18日,大阪府立大学中百舌鳥キャンパス,堺市

  15. X-ray structure analysis of the [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter sp. S-77(招待講演)
  16. Y. Shomura
    I2CNER International Workshop 2015
    4 Feb 2015,Kyusyu Univ.,Fukuoka

  17. Ni-Fe型水素分解酵素の構造化学的研究(口頭発表)
  18. 庄村康人
    異分野融合若手研究者Science & Technology クラブ
    2014年12月1-4日,姫路市じばさんびる,姫路市

  19. 結晶構造解析による水素分解酵素の反 応機構解明に向けた試み(口頭発表)
  20. 庄村康人,西川幸志, 井上誠也,玉田太郎,樋口 芳樹
    蛋白質研究所セミナー「結晶構造を併用したハイブリッド構造研究の最前線」
    2014年2月7-8日,大阪大学,吹田市

  21. [NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析(招待講演)
  22. 庄村康人
    第27回 日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    2014年1月11-13日,広島国際会議場,広島市


原著論文

  1. Structural basis of the redox switches in the NAD+-reducing soluble [NiFe]-hydrogenase.
  2. Shomura Y.*,†, Taketa M.*, Nakashima H., Tai H., Nakagawa H., Ikeda Y., Ishii M., Igarashi Y., Nishihara H., Yoon K-S., Ogo S., Hirota S., Higuchi Y.
    Science, 357(6354) 928-932. 2017
    *Equally contributed authors
    Double corresponding authors

  3. Rational Design of Domain-Swapping-Based c-Type Cytochrome Heterodimers by Using Chimeric Proteins.
  4. Zhang M., Nakanishi T., Yamanaka M., Nagao S., Yanagisawa S., Shomura Y., Shibata N., Ogura T., Higuchi Y., Hirota S.
    Chembiochem, 18(17) 1712-1715. 2017

  5. Synthesis and Reactivity of a Water-soluble NiRu Monohydride.
  6. Matsumoto T., Yoshimoto K., Zheng C., Shomura Y., Higuchi Y., Nakai H., Ogo S.
    Chem. Lett., 45(2) 197-199. 2016

  7. Domain-swapped cytochrome cb562 dimer and its nanocage encapsulating a Zn-SO4 cluster in the internal cavity.
  8. Miyamoto T., Kuribayashi M., Nagao S., Shomura Y., Higuchi Y., Hirota S.
    Chem.Sci., 6(12) 7336-7342. 2015

  9. Oligomerization enhancement and two domain swapping mode detection for thermostable cytochrome c552 via the elongation of the major hinge loop.
  10. Ren C., Nagao S., Yamanaka M., Komori H., Shomura Y., Higuchi Y., Hirota S.
    Mol. Biosyst., 11(12) 3218-3121. 2015

  11. Crystallization and preliminary X-ray analysis of the NAD+-reducing [NiFe] hydrogenase from Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1.
  12. Taketa M., Nakagawa H., Habukawa M., Osuka H., Kihira K., Komori H., Shibata N., Ishii M., Igarashi Y., Nishihara Y., Yoon K-S., Ogo S., Shomura Y., Higuchi Y.
    Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun., 71(Pt 1) 96-99. 2015

  13. Refined Regio- and Stereoselective Hydroxylation of l-Pipecolic Acid by Protein Engineering of l-Proline cis-4-Hydroxylase Based on the X-ray Crystal Structure.
  14. Koketsu K., Shomura Y., Moriwaki K., Hayashi M., Mitsuhashi S., Hara R., Kino K., Higuchi Y.
    ACS Synth. Biol., 4(4) 383-392. 2015

  15. Rational Design of Heterodimeric Protein using Domain Swapping for Myoglobin.
  16. Lin Y.W., Nagao S., Zhang M., Shomura Y., Higuchi Y., Hirota S.
    Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 54(2) 511-515. 2015

  17. Photosensitivity of the Ni-A state of [NiFe] hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F with visible light.
  18. Osuka H., Shomura Y., Komori H., Shibata N., Nagao S., Higuchi Y., Hirota S.
    Biochem. Biophys. Res. Commun., 430(1) 284-288. 2013

  19. Crystal structure analysis of the translation factor RF3 (release factor 3).
  20. Kihira K., Shimizu Y., Shomura Y., Shibata N., Kitamura M., Nakagawa A., Tsukihara T., Ueda T., Ochi K., Higuchi Y.
    FEBS Lett., 586(20) 3705-3709. 2012

  21. Structural and oxygen binding properties of dimeric horse myoglobin.
  22. Nagao S., Osuka H., Yamada T., Uni T., Shomura Y., Imai K., Higuchi Y., Hirota S.
    Dalton Trans., 41(37) 11378-11385. 2012

  23. Structural basis for the reaction mechanism of S-carbamoylation of HypE by HypF in the maturation of [NiFe]-hydrogenases.
  24. Shomura Y.*, Higuchi Y.*
    J. Biol. Chem., 287(34) 28409-28419. 2012
    *Double corresponding authors

  25. Structural and enzymatic characterization of BacD, an L-amino acid dipeptide ligase from Bacillus subtilis.
  26. Shomura Y., Hinokuchi E., Ikeda H., Senoo A., Takahashi Y., Saito J., Komori H., Shibata N., Yonetani Y., Higuchi Y.
    Protein Sci., 21(5) 707-716. 2012

  27. Structural basis for [4Fe-3S] cluster in the O2-tolerant membrane-bound [NiFe] hydrogenase.
  28. Shomura Y., Yoon K-S., Nishihara H., Higuchi Y.
    Nature, 479(7372) 253-256. 2011

  29. Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of membrane-bound respiratory [NiFe] hydrogenase from Hydrogenovibrio marinus.
  30. Shomura Y., Hagiya K., Yoon K-S., Nishihara H., Higuchi Y.
    Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun., 67(Pt7) 827-829. 2011

  31. Crystallographic characterization of the DIX domain of the Wnt signalling positive regulator Ccd1.
  32. Terawaki S., Yano K., Katsutani T., Shiomi K., Keino-Masu K., Masu M., Shomura Y., Komori H., Shibata N., Higuchi Y.
    Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun., 67(Pt7) 758-761. 2011



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